Standar Audit Intern Pemerintah Indonesia (SAIPI) mengamanatkan Pimpinan APIP harus mengembangkan dan menjaga program penjaminan dan peningkatan kualitas yang mencakup seluruh aspek Pengawasan Intern. Interpretasi atas standar tersebut merupakan latar belakang Program Penjaminan dan Peningkatan Kualitas dirancang untuk memungkinkan dilakukannya evaluasi kesesuaian pelaksanaan Pengawasan Intern terhadap Standar dan bagaimana penerapan Kode Etik oleh Auditor serta mengidentifikasi peluang peningkatan efisiensi dan efektivitas pelaksanaan Pengawasan Intern. Sebagaimana tertuang pada Pedoman Telaah Sejawat Ekstern APIP dengan nomor KEP-06/AAIPI/DPN/2024 Tanggal 4 Juni 2025, Program Penjaminan dan Peningkatan Kualitas bertujuan untuk:
1. Mendorong kesesuaian kegiatan pengawasan intern dengan standar dan kode etik Asosiasi Auditor Intern Pemerintah Indonesia (AAIPI);
2. Meningkatkan efektivitas, efisiensi, dan nilai tambah kegiatan pengawasan intern dalam membantu mewujudkan tujuan organisasi dan memenuhi harapan pemangku kepentingan; serta
3. Mengidentifikasi peluang peningkatan kualitas kegiatan pengawasan intern APIP.

Adapun Kegiatan Pengawasan Intern terbagi menjadi 3 (tiga) eleman utama, yaitu governane (tata kelola), profesional practice (praktik profesional), dan communication (komunikasi). Paling tidak, 1 (satu) kali dalam tiga tahun penelaahan ekstern harus dilakukan oleh pihak yang independen dan berkualitas yang berasal dari luar APIIP.
Di Tahun 2025 ini, AAIPI Dewan Perwakilan Nasional Provinsi Jawa Timur telah menentukan waktu dan pembagian penelaah-ditelaah antar APIP di wilayah Jawa Timur . Inspektorat Jombang sendiri ditelaah oleh Inspektorat Kabupaten Tuban dan dilaksanakan mulai pertengahan April sampai dengan bulan Mei 2025. Sedangkan, sebagai tim penelaah, Inspektorat Kabupaten Jombang sedang melakukan penelaahan kepada Inspektorat Kabupaten Sidoarjo mulai Tanggal 21 April s/d 5 Mei 2025. Setiap hasil telah oleh APIP terhadap APIP lain, nantinya akan dilakukan Quality Assurance ke Badan Pengawasan Keuangan dan Pembangunan (BPKP) Provinsi Jawa Timur sebelum dirilis. Nilai yang diperoleh oleh masing-masing APIP akan sangat berpengaruh terhadap nilai Kapabilitas APIP.
